BOINC Linux :)

[firewall]

Witam
Mam taki mały problemik, że BIONIC bez problemu pobiera i przetwarza... ale niechcę wysyłać...
sami zobaczcie

Kod [Zaznacz] Rozwiń

http://www.postimage.org/Pq29urY9-118e28ece8924d0f142f62fc5cd2d894.png

Uzbierało mi się już mi się parę takich zadań.

Tutaj macie screena z wiadomości, tam podejrzewam jest przyczyna problemu opisana :

Kod [Zaznacz] Rozwiń

http://www.postimage.org/image.php?v=aVZvTTS

A tutaj macie moje reguły firewalla :

Kod [Zaznacz] Rozwiń


> iptables -L
Chain INPUT (policy DROP)
target     prot opt source               destination
ACCEPT     all  --  anywhere             anywhere            state RELATED,ESTABLISHED
ACCEPT     icmp --  anywhere             anywhere            limit: avg 1/sec burst 5
ACCEPT     all  --  anywhere             anywhere
REJECT     tcp  --  anywhere             anywhere            tcp dpt:auth reject-with icmp-port-unreachable
REJECT     tcp  --  anywhere             anywhere            tcp dpt:socks reject-with icmp-port-unreachable

Chain FORWARD (policy DROP)
target     prot opt source               destination

Chain OUTPUT (policy ACCEPT)
target     prot opt source               destination
ACCEPT     all  --  anywhere             anywhere


Jak widać mam odblokowane wszystkie połączenia wychodzące czyli powinno być OK :)
Proszę o pomoc pozdrawiam... może odplokować jakies IP albo porty na INPUT albo coś innego ?

[Mchl]

Twierdzi, że połączenie znalazł, ale nikt nie chce przesyłki odebrać. Możliwe że chwilowe problemy po stronie projektu. Podłącz się na próbę do innego projektu i sprawdź czy będzie działał.

[Mateusz]

Witam, pozwólcie, że napiszę tutaj, aby nie dublować tematów. Również mam problem z BOINC'iem pod Linuxem. Przy pierwszym uruchomieniu działał sprawnie. Przy następnym w graficznym trybie pojwiła się informacja: "Brak dostępnej pamięci RAM". Sądzę, że może to być sprawa ustwień gdyż już działał, a poza tym nie mam chyba aż tak mało pamięci aby ruszył. Przecież Linux zabiera mniej zasobów niż XP (mam Ubuntu 7.10), a pod windowsem działało ok.

Konsola z kolei wypluwa coś takiego:

Kod [Zaznacz] Rozwiń

mateusz@mateusz-desktop:~$ boinc
2008-04-17 10:29:17 [---] Starting BOINC client version 5.10.8 for i686-pc-linux-gnu
2008-04-17 10:29:17 [---] log flags: task, file_xfer, sched_ops
2008-04-17 10:29:17 [---] Libraries: libcurl/7.16.4 OpenSSL/0.9.8e zlib/1.2.3.3 libidn/1.0
2008-04-17 10:29:17 [---] Data directory: /home/mateusz
2008-04-17 10:29:17 [---] Processor: 1 AuthenticAMD AMD Athlon(tm) [Family 6 Model 8 Stepping 1]
2008-04-17 10:29:17 [---] Processor features: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 mmx fxsr sse syscall mp mmxext 3dnowext 3dnow up ts
2008-04-17 10:29:17 [---] Memory: 249.95 MB physical, 2.80 GB virtual
2008-04-17 10:29:17 [---] Disk: 12.07 GB total, 11.18 GB free
2008-04-17 10:29:17 [---] No general preferences found - using BOINC defaults
2008-04-17 10:29:17 [---] Preferences limit memory usage when active to 124.97MB
2008-04-17 10:29:17 [---] Preferences limit memory usage when idle to 224.95MB
2008-04-17 10:29:17 [---] Preferences limit disk usage to 6.04GB
2008-04-17 10:29:46 [---] [error] GUI RPC bind failed: 98
gstate.init() failed: -180
mateusz@mateusz-desktop:~$

Problem pojawia się przy Rosetta@Home, Seti@Home działa normalnie.
Z góry dziękuję za pomoc. :)

[Pigu]

a ile masz ramu i ile rdzeni?

[Mateusz]

256 Mb
Jeśli o to pytasz  - 1 kość.

O co Ci chodziło z rdzeniami? Przyznaję, że nie wiem o co chodzi.  ::)

[bartsob5]

ja obstawiam, ze trzeba w preferencjach lokalnych zwiekszyc % uzywanej ilosc pamieci ram (daj tam wartosci 80-90 (tak, zeby x% ramu stanowilo okolo 700-800MB) a powinno to wystarczyc zeby rosetta ruszyla)

edit:

o... tylko 256? to chyba oznacza ze o rosetcie mozesz calkiem zapomniec... :(

[Pigu]

chodziło mi o rdzenie procesora - wiadomo - 4 rdzenie, 4x np ralph = z 300-600mb ramu + drugie tyle w swapie
rekordzistą jest na ten moment predictor któremu próbki puchną wraz z postępem - pod koniec predzio bierze lekko 400mb ramu i 1gb swapa na próbkę - kończenie 4rech na raz to sztuka wybitna

[bartsob5]

jestes pewien? nie dalej jak godzine temu mialem w ramie probke rosetty zajmujaca 400MB... nalezy sie domyslac, ze drugie tyle bylo w pliku stronicowania...

[Mateusz]

o... tylko 256? to chyba oznacza ze o rosetcie mozesz calkiem zapomniec... :(

A szkoda, bo wiąże się to z moimi naukowymi zainteresowaniami - immunologia/biologia molekularna (studiuję biotechnologię). Pytanie tylko czemu pod Windowsem wszystko jest ok... ;/ Nie wiem ile rdzeni ma mój procesor, wiem, że mam jeden i jest to AMD Sempron 2400+. Maszyna może i nie najnowszej generacji, ale do tego co robie starcza, lub starczała, jeśli nie odpalę Rosetty. Z tego co pamiętam (teraz jestem pod Windowsem) na Rosettę mam przeznaczone 50% RAM'u, spróbuję zmienić. Jeśli zaś mowa o swap - mam ok 3 gb.

[bartsob5]

sempron 2400+ ma tylko jednego rdzenia...

ta roznica w dzialaniu wynika z tego, ze pod linuksa i windowsa musza byc rozne aplikacje, - ich budowa jest rozna wiec zapotrzebowanie na RAM tez zapewne jest inne..

[Mateusz]

No nic, trudno, próbowałem przestawić na 90%, ale preferencje w BOINC nie są skłonne do współpracy niestety. Zostają inne projekty biochemiczne. Próbuję teraz odpalić Lattice.  Wielkie dzięki za pomoc. ;]

[Mchl]

I odpalasz XP na 256MB RAMu? Wiem że się da... ale...

Sam procesorek masz całkiem fajny. Kostka 1GB pamięci DDR kosztuje 88zł. Zastanów się ;)

[bartsob5]

ja odpalalem na 128... jechalem na nim w szczytowym okresie 6-8 projektow... naraz... ale dopasowywalem je bardzo dokladnie, nie byly one przypadkowe...

[Pigu]

jestes pewien? nie dalej jak godzine temu mialem w ramie probke rosetty zajmujaca 400MB... nalezy sie domyslac, ze drugie tyle bylo w pliku stronicowania...

jestem pewien hehe mówiłem przecież o ralphie nie o rosettcie  ;D

btw - managera zadań można w 2 klikach dostosować by pokazywał też ile siedzi w swapie

[Mateusz]

I odpalasz XP na 256MB RAMu? Wiem że się da... ale...

Sam procesorek masz całkiem fajny. Kostka 1GB pamięci DDR kosztuje 88zł. Zastanów się ;)

W sumie dobry pomysł, ciekawe tylko czy gdzieś jeszcze dostanę kości, które będą pasowały do mojego kompa. ;) Poza tym i tak się zastanawiam nad jakimś przystępnym laptopem. ;)

Tak się zastanawiam... Gdyby spróbować odpalić jakoś w wersji textowej pod konsolą? ;>

[Mchl]

Spokojnie kupisz. O ile się nie mylę DDR 182pin. Chociaż to chyba ostatni gwizdek i zaraz zaczną już drożeć jako sprzęt wychodzący z obiegu :P.

[Troll81]

już drożeją... DDR II są już tańsze. Ja usiłuję kupić athlona 64 X2 4800 na socket 939, ale jak to ktoś ujął "są rzadkie jak zęby koguta"

[Mateusz]

Trzeba będzie na allegro zajrzeć. ;)

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_requirements.php Według tego co tu piszą powinno śmigać na 256...  ::) Wiem, że może szukam dziury w całym, ale nie wiem kiedy RAM dokupie a policzyłoby się Rosettę. ;P

[MarcinG]

Dla zainteresowanych:

http://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/SoftwareDevelopment

jak myslicie ? czy daloby rade cos wykrzesac i zrobic boinca na linuxa x64 pod SSE 4.1 ??? . Nie znam sie za bardzo na tych rzeczach ale sluze kompem i po wskazowkach moglbym zaczac cos kompilowac ;)

[Troll81]

BOINC to tylko platforma do odpalania projektów i raczej nie ma sensu tworzenie specjalnej wersji wykorzystującej SSE 4.1 (za to warto optymalizować aplikacje projektów, gdyż to od nich zależy czas przeliczania). Ważne jest żeby istniał klient BOINC pod 64bitowe linuxy w ogólności (a z tego co wiem to istnieje).

[MarcinG]

Konsola z kolei wypluwa coś takiego:

mateusz@mateusz-desktop:~$ boinc
2008-04-17 10:29:17 [---] Starting BOINC client version 5.10.8 for i686-pc-linux-gnu
2008-04-17 10:29:17 [---] log flags: task, file_xfer, sched_ops
2008-04-17 10:29:17 [---] Libraries: libcurl/7.16.4 OpenSSL/0.9.8e zlib/1.2.3.3 libidn/1.0
2008-04-17 10:29:17 [---] Data directory: /home/mateusz
2008-04-17 10:29:17 [---] Processor: 1 AuthenticAMD AMD Athlon(tm) [Family 6 Model 8 Stepping 1]
2008-04-17 10:29:17 [---] Processor features: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 mmx fxsr sse syscall mp mmxext 3dnowext 3dnow up ts
2008-04-17 10:29:17 [---] Memory: 249.95 MB physical, 2.80 GB virtual
2008-04-17 10:29:17 [---] Disk: 12.07 GB total, 11.18 GB free
2008-04-17 10:29:17 [---] No general preferences found - using BOINC defaults
2008-04-17 10:29:17 [---] Preferences limit memory usage when active to 124.97MB
2008-04-17 10:29:17 [---] Preferences limit memory usage when idle to 224.95MB
2008-04-17 10:29:17 [---] Preferences limit disk usage to 6.04GB
2008-04-17 10:29:46 [---] [error] GUI RPC bind failed: 98
gstate.init() failed: -180

http://boinc.berkeley.edu/dev/forum_thread.php?id=2355
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/boinc/+bug/163853