DrugDiscovery@Home

[krzyszp]

Nie do końca, zobacz na moje dwa hosty... Przeliczają WU z tej samej serii (czyli ten sam przewidywany czas), a ten z mocniejszą kartą, wykonujący szybciej WU dostaje znacznie więcej pkt.

Na razie nie mam pomysłu, co zrobić z punktacją, zwłaszcza że jak pisałem, dokładnie te same WU wykonują się w różnych czasach... A co dopiero, jak dojdą już różne WU (dla każdego WU inne dane wejściowe), gdzie będzie bardzo duży rozstrzał...

[sknd]

a nie można jakoś uzależnić punktacji od czasu trwania obliczeń (rzeczywistego, nie przewidywanego)? Zdaje się, że w WCG tak jest

[krzyszp]

a nie można jakoś uzależnić punktacji od czasu trwania obliczeń (rzeczywistego, nie przewidywanego)? Zdaje się, że w WCG tak jest

To bez sensu, właściciele lepszych graf by nie byli promowani...

[kva.pl]

A co wlasciwie obliczaja aktualne WU?

[tito]

Faktycznie, moja teoria legła w gruzach - tylko 2 WU dostały po 500k.
Osobiście widzę stałaą punktację za WU - ww dłuższej perspetywie średnia będzie stała, zaś większy RAC będą miały osoby z lepszym sprzętem. Chyba, że kolejne batche próbek będą się znacznie od siebie różniły czasem przeliczenia.

[krzyszp]

A co wlasciwie obliczaja aktualne WU?

Generalnie, to teraz testujemy najnowsze metody testowania białek mogących mieć zastosowanie w medycynie (wiem, brzmi jak masło maślane, ale tak jest).
Sprawa jest dość poważna, bo już przy poprzednich testach udało się osiągnąć trafienia lepsze o 10% niż innym badaczom.

W sumie, (z tego co ja sam wiem) chodzi o znalezienie związków, które rodzą nadzieję na potencjalne lekarstwa z bazy danych setek milionów potencjalnych związków.

[kva.pl]

A na co to maja byc lekarstwa?

[krzyszp]

A na co to maja byc lekarstwa?

Nie tak... Tu chodzi o związki chemiczne, które mogą być podstawą do budowania białek po następne lekarstawa... Jakie? To dopiero laboratoria będą rozpracowywać, my robimy tzw. "badania podstawowe", tzn eliminujemy związki "bez szas"...

[sknd]

a nie można jakoś uzależnić punktacji od czasu trwania obliczeń (rzeczywistego, nie przewidywanego)? Zdaje się, że w WCG tak jest

To bez sensu, właściciele lepszych graf by nie byli promowani...

a jakby punktacja zależała od ilości wykonanych obliczeń? nie wiem, czy jest jakiś "licznik" ile MIPS-ów czy GIPS-ów jest wykonywanych w WU? to by było sprawiedliwe chyba

[krzyszp]

Niestety, ale chyba nie ma takiego licznika.

[kva.pl]

No dobra, ale za badania podstawowe to z tego co wiem nikt nie chce placic (poza grantami czasem), a to mial byc przeciez komercyjny projekt?

[krzyszp]

No dobra, ale za badania podstawowe to z tego co wiem nikt nie chce placic (poza grantami czasem), a to mial byc przeciez komercyjny projekt?

W tym przypadku myślę, że na celowniku są zlecenia z uczelni (ale ja się w to nie mieszam, więc dokładnie nie wiem).

[mimeq]

Widze nowa wersja apki z 0.19 na 0.23. Pierwsza 0.23 czas podobny jak na 0.19 a druga po 6h ma 20%  :fright:

[krzyszp]

Widze nowa wersja apki z 0.19 na 0.23. Pierwsza 0.23 czas podobny jak na 0.19 a druga po 6h ma 20%  :fright:

Czas będzie taki sam, ja manipuluję ustawieniami fpops żeby się wstrzelić w prawidłowy czas.

[tito]

To jak z punktacją? Rozbieżności między czasami przeliczeń komputerów są ogromne.

[Ufol]

Czy istnieją szanse na gpowe mielenie w najbliższych dniach? Na Nvidię nic nie mogę pobrać. Smerfnie by było zaprząc do pracy również Ati.

[krzyszp]

Na Nvidię na dniach pojawi się kilka tysięcy WU, AMD niestety na razie będzie czekać.

[IThorne]

Projekt wciąż jest testowy czy wspomaga już naukę?

Jeśli to pierwsze to kiedy jest planowane prawdziwe liczenie?

[krzyszp]

Te kilka tysięcy WU ma być częścią większej bazy przeliczonych próbek, których jakoś nikt nigdy nie przeliczył, a są dobrą bazą pod badania.
Generalnie będzie tego dużo, ale w małych porcjach. Niestety, design bazy białek jest taki, że słabo automatyzuje się generowanie WU i w praktyce na każde kilka tysięcy WU będę musiał pisać osobny generator (mówię tu o Gromacsie).

[kva.pl]

Ok, policzylem jedno WU na GT 1050. Niezbyt mocna grafa, a obciążenie GPU było średnio 32%. To normalne i tak ma być?

[krzyszp]

Ok, policzylem jedno WU na GT 1050. Niezbyt mocna grafa, a obciążenie GPU było średnio 32%. To normalne i tak ma być?

Tak, to specyfika tej aplikacji, po prostu tylko część działań jest przerzucona na GPU.
Ja po prostu odpalam 2 WU naraz.

[tito]

Coś się dzieje w projekcie? Czy znowu zgrzyty?

[krzyszp]

Nie, po prostu nowa apka czeka na sensowne przygotowanie zadań dla niej... Niestety, to musi trochę potrwać.

[tito]

No, ja na najbliższe 150 dni mam zatrudnienie dla GPU. Wtedy mam nadzieję, że projekt ruszy pełną parą.

[andy101fah]

Taka mała reklama Boinc@Poland

[Grzegorz R. Granowski]

Taka mała reklama Boinc@Poland

Reklama - czy informacja?!?

[andy101fah]

Takie malutkie logo to tylko mały banerek reklamowy, każdy projekt losowo wybiera użytkownika i prezentuje go na głównej stronie, jeżeli użytkownik wypełnił profil na stronie danego projektu. Tutaj jak widzę nie wyświetla mojego profilu gdzie mam sygnaturki liczonych projektów. One są zrozumiałe w całym świecie BOINC.

[tito]

http://boinc2.drugdiscoveryathome.com/
Forum puste, wszystko puste.

Coś się dzieje w temacie?