Porównanie wyników rosetty i predictora

[gaciu]

Oto wyniki eksperymentu CASP6 porównujące algorytmy rosetty i predictora:

rosetta vs. predictor

Niebieskie słupki to wynik średni dla wszystkich aplikacji. Zielony słupek wyznacza najlepszy i najgorszy wynik. Wynik osiągnięty przez Predictora oznaczony jest czerwoną kreską, a Rosette pomarańczowym trójkątem. Pozioma oś wyznacza kolejne testowane proteiny.

Rosetta wypada lepiej we wszystkich testowanych proteinach (poza pierwszą). W związku z niesatysfakcjonującymi wynikami twórcy Predictora zamierzają wkrótce zmienić algorytm

CASP ( Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction ) to konferencja specjalistów mająca na celu określenie aktualnych możliwości przewidywania struktury białek (odbywa się dwa razy do roku). Jako sprawdzian wykonuje się swego rodzaju ćwiczenia na zgłoszonych do konkursu algorytmach. Wkródce odbędzie się kolejna edycja - CASP7. Link jest ->tu<-

Algorytm rosetty jak i predictora nie są tymi najnowszymi. Ich rocznik to 2004. Najnowsze aplikacje będą przetestowane w CASP7 w kwietniu. Smutne jest to, że na wyniki konkursu trzeba czekac dość długo (kilka miesięcy), więc nie dowiemy szybko.[/url]

[matti_tm]

Konkursy CASP, problemy z przewidywaniem kształtów protein oraz niektóre metody (w tym rosetta) były opisane w lutowym numerze Świata Nauki.