Samoczynny restart próbki

[DanieI]

Witam,
Mam jedną próbkę, która po osiągnięciu 90-ęciu paru procent strasznie zwolniła przeliczanie. Checkpointy robi, ale co jakiś czas sama się restartuje. Może ktoś wie, o co chodzi?

Przykład dzisiejszego liczenia i te restarty:

2008-09-29 17:57:19|rosetta@home|Restarting task hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 using minirosetta version 134
2008-09-29 18:14:25|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:21:06|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:26:24|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:28:58|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:31:10|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:33:49|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:36:05|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:38:48|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:41:30|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:44:23|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 18:58:04|rosetta@home|Restarting task hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 using minirosetta version 134
2008-09-29 19:16:08|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 19:28:25|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 19:35:40|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 19:39:09|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 19:41:36|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 19:45:52|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 19:50:01|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 19:53:22|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:06:08|rosetta@home|Restarting task hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 using minirosetta version 134
2008-09-29 20:24:17|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:29:11|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:33:04|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:36:11|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:38:54|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:43:22|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:46:51|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:49:16|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 20:51:35|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 21:00:29|rosetta@home|Restarting task hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 using minirosetta version 134
2008-09-29 21:13:21|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 21:17:02|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 21:20:15|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed
2008-09-29 21:23:10|rosetta@home|[checkpoint_debug] result hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 checkpointed

[REPAIRMAN]

Moze wykasowanie tej probki i pobranie nowej ( wtedy bedziesz wiedzial czy to wina probek czy moze czegos innego )

[kempler]

Proponuje także zgłoszenie tego na forum projektu w wątku o problemach minirosetta 1.34 http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=4369

[Bober]

A czy to nie problem z pamięcią? Rosetta ma tendencje do przechodzenia w status "Waiting for memory". Nie informuje o tym w wiadomościach. Trzeba sprawdzać status próbki.

[DanieI]

Ustawiłem w cc_config parę innych logów, ale nie umiem ich zinterpretować. Pomożecie?

2008-10-01 21:49:42||[cpu_sched_debug] enforce_schedule: end
2008-10-01 21:49:43||[cpu_sched] Suspending - CPU throttle
2008-10-01 21:49:43|rosetta@home|[cpu_sched] Preempting abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 (left in memory)
2008-10-01 21:49:43|rosetta@home|[task_debug] task_state=SUSPENDED for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from suspend
2008-10-01 21:49:44||[cpu_sched] Resuming - CPU throttle
2008-10-01 21:49:44|rosetta@home|[cpu_sched] Resuming abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:49:44|rosetta@home|[task_debug] task_state=EXECUTING for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from unsuspend
2008-10-01 21:49:53||[cpu_sched] Suspending - CPU throttle
2008-10-01 21:49:53|rosetta@home|[cpu_sched] Preempting abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 (left in memory)
2008-10-01 21:49:53|rosetta@home|[task_debug] task_state=SUSPENDED for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from suspend
2008-10-01 21:49:54||[cpu_sched] Resuming - CPU throttle
2008-10-01 21:49:54|rosetta@home|[cpu_sched] Resuming abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:49:54|rosetta@home|[task_debug] task_state=EXECUTING for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from unsuspend
2008-10-01 21:50:03||[cpu_sched] Suspending - CPU throttle
2008-10-01 21:50:03|rosetta@home|[cpu_sched] Preempting abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 (left in memory)
2008-10-01 21:50:03|rosetta@home|[task_debug] task_state=SUSPENDED for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from suspend
2008-10-01 21:50:04||[cpu_sched] Resuming - CPU throttle
2008-10-01 21:50:04|rosetta@home|[cpu_sched] Resuming abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:50:04|rosetta@home|[task_debug] task_state=EXECUTING for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from unsuspend
2008-10-01 21:50:13||[cpu_sched] Suspending - CPU throttle
2008-10-01 21:50:13|rosetta@home|[cpu_sched] Preempting abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 (left in memory)
2008-10-01 21:50:13|rosetta@home|[task_debug] task_state=SUSPENDED for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from suspend
2008-10-01 21:50:14||[cpu_sched] Resuming - CPU throttle
2008-10-01 21:50:14|rosetta@home|[cpu_sched] Resuming abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:50:14|rosetta@home|[task_debug] task_state=EXECUTING for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from unsuspend
2008-10-01 21:50:23||[cpu_sched] Suspending - CPU throttle
2008-10-01 21:50:23|rosetta@home|[cpu_sched] Preempting abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 (left in memory)
2008-10-01 21:50:23|rosetta@home|[task_debug] task_state=SUSPENDED for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from suspend
2008-10-01 21:50:24||[cpu_sched] Resuming - CPU throttle
2008-10-01 21:50:24|rosetta@home|[cpu_sched] Resuming abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:50:24|rosetta@home|[task_debug] task_state=EXECUTING for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from unsuspend
2008-10-01 21:50:33||[cpu_sched] Suspending - CPU throttle
2008-10-01 21:50:33|rosetta@home|[cpu_sched] Preempting abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 (left in memory)
2008-10-01 21:50:33|rosetta@home|[task_debug] task_state=SUSPENDED for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from suspend
2008-10-01 21:50:34||[cpu_sched] Resuming - CPU throttle
2008-10-01 21:50:34|rosetta@home|[cpu_sched] Resuming abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:50:34|rosetta@home|[task_debug] task_state=EXECUTING for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from unsuspend
2008-10-01 21:50:37||[cpu_sched_debug] CPU efficiency old 0.777698 new 0.777738 wall 60.000000 CPU 50.140000 w 0.999306 e 0.835667
2008-10-01 21:50:43||[cpu_sched] Suspending - CPU throttle
2008-10-01 21:50:43|rosetta@home|[cpu_sched] Preempting abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 (left in memory)
2008-10-01 21:50:43|rosetta@home|[task_debug] task_state=SUSPENDED for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from suspend
2008-10-01 21:50:44||[cpu_sched] Resuming - CPU throttle
2008-10-01 21:50:44|rosetta@home|[cpu_sched] Resuming abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:50:44|rosetta@home|[task_debug] task_state=EXECUTING for abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 from unsuspend
2008-10-01 21:50:44||[cpu_sched_debug] enforce_schedule(): start
2008-10-01 21:50:44|rosetta@home|[cpu_sched_debug] want to run: abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:50:44|rosetta@home|[cpu_sched_debug] processing abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0
2008-10-01 21:50:44|rosetta@home|[cpu_sched_debug] abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 is already running
2008-10-01 21:50:44||[cpu_sched_debug] finished preempt loop, ncpus_used 1.000000
2008-10-01 21:50:44|rosetta@home|[cpu_sched_debug] hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t315___4592_834_0 sched state 1 next 1 task state 0
2008-10-01 21:50:44|rosetta@home|[cpu_sched_debug] abinitio_nohomfrag_70_A_2hcmA_4482_14938_0 sched state 2 next 2 task state 1
2008-10-01 21:50:44||[cpu_sched_debug] enforce_schedule: end

[Bober]

Jakie masz ustawienie "use at most x% of CPU time" ? Jeżeli zmniejszyłeś ze 100% to właśnie tak działa ta opcja, co kilka sekund wstrzymuje obliczenia.

[DanieI]

Miałem 90%, już poprawiłem na 100%. To jest już druga próbka pod rząd, która po 95% niesamowicie zwolniła liczenie. Nie wiem o co chodzi. Mam jeszcze jedną w kolejce, gdzie pokazuje czas przeliczenia około 5:50 godz., a wcześniej liczyły mi się w około 2:30 godz. Przynajmniej taki czas był wyświetlany w kolumnie - Pozostało. Czy taka próbka, która się będzie liczyła jeszcze mnóstwo czasu (o ile zdąży przed terminem zaraportowania) da jakieś punkty i będzie z niej pożytek dla bezpośrednio zainteresowanych badaczy?

[Bober]

Próbki Rosetty pod koniec obliczeń wymagają większej ilości pamięci. To że "pod koniec" próbka stoi dłużej na np. 95%, wynika z tego, że jest to szacunkowy postęp i szacunkowy czas pozostały.

Są różne rodzaje zadań - nowe zadania typu AA2A liczą się dłużej od starszych i to niezależnie od ustawień w preferencjach. W Rosecie zawsze były zadania, które np. potrafiły liczyć się 8h mimo ustawienia czasu przeliczania na 3h i były to poprawne próbki, po prostu zdarzają się "trudniejsze" przypadki.

Przejrzałem twoje wyniki - wszystko jest w porządku. Możesz spokojnie liczyć.

Czy taka próbka, która się będzie liczyła jeszcze mnóstwo czasu (o ile zdąży przed terminem zaraportowania) da jakieś punkty i będzie z niej pożytek dla bezpośrednio zainteresowanych badaczy?

Oczywiście  :D