Nowy podprojekt WCG - Say No to Schistosoma

[RAD-Poland]

Say No to Schistosoma

Link do opisu nowego projektu na stronie WCG:

Kod [Zaznacz] Rozwiń

http://www.worldcommunitygrid.org/research/sn2s/overview.do

nowa odznaka

[emik]

właśnie zauważyłem, że pobrało nową aplikację

[Troll81]

Powiedz nie Schistosomatozie

Misja

Misją projektu Say No to Schistosoma jest wskazanie potencjalnych leków które prawdopodobnie rozwiną się w terapie przeciw Schistosomatozie. Olbrzymia moc obliczeniowa World Community Grid zostanie wykorzystana do przeprowadzenia symulacji interakcji pomiędzy milionami związków chemicznych i pewnymi białkami docelowymi. Pomoże to odnaleźć najbardziej obiecujące związki które mogą doprowadzić do skutecznego leczenia tej choroby

Znaczenie

Schistosomatoza jest chorobą tropikalną, powodowaną pasożytniczymi przywrami których nosicielami są słodkowodne ślimaki. Choroba rocznie zabija 200 000 ludzi a dotyka 207 milionów. Schistosomatoza jest drugą zaraz po malarii najbardziej socjoekonomicznie dewastującą chorobą. Naukowcy w Infórium University w Belo Horizonte i  FIOCRUZ-Minas w Brazylii używają World Community Grid w poszukiwaniach związków chemicznych mogących prowadzić do powstania nowych leków na tę chorobę.

Podejście

Program zwany VINA z instytutu badawczego Scripps w La Jolla w Kalifornii zostanie użyty do przeprowadzenia wirtualnych eksperymentów chemicznych. Te eksperymenty mają za zadanie wskazać które z pośród milionów związków chemicznych mogą wyłączyć pewne konkretne białka niezbędne pasożytowi do przeżycia. Takie poszukiwania potencjalnych leków jest wstępnym krokiem w procesie tworzenia efektywnych terapii choroby. Przy użyciu odpowiednio dużej mocy obliczeniowej takie badania mogą zostać przeprowadzone znacznie szybciej niż przy użyciu tradycyjnych metod laboratoryjnych. Istniejące komputery dostępne naukowcom potrzebowałyby w przybliżeniu 30 lat na przeprowadzenie obliczeń. Jednakże, szacuje się że moc obliczeniowa World Community Grid zredukuje ten czas do roku lub mniej. Informacje o najlepszych "kandydatach" na leki zostaną opublikowane przez naukowców i będą publicznie dostępne tak by inni naukowcy mogli wykorzystać je w swoich badaniach. Dalsza praca laboratoryjna z użyciem tych wyselekcjonowanych związków może doprowadzić do wynalezienia lepszych leków na Schistosomatozę.

[goofyx]

eh, dali by człowiekowi chwile żeby szafiry pozdobywać ;)

[Kryniek]

No i fajnie. Z WCG nudzić się nie można, a już na pewno nie zabraknie nam próbek do liczenia ;)

Co do samego projektu to szczytny i dobrze że powstał. Pierwszy raz słyszę o tej chorobie, ale z opisu wygląda paskudnie.
No i w sporej ilości krajów występuje

[Troll81]

http://www.boincatpoland.org/wiki/Say_No_to_Schistosoma

oczekuja na tłumaczenie

Kod [Zaznacz] Rozwiń

http://www.worldcommunitygrid.org/research/sn2s/details.do

Kod [Zaznacz] Rozwiń

http://www.worldcommunitygrid.org/research/sn2s/faq.do

i mysle że i do pozostałych podprojektów WCG przydałoby się zrobić takie tłumaczenie....

[_Aleksander_]

Każdy nowy podprojekt WCG cieszy. Dla kolekcjonerów to okazja do malowania kolejnej odznaki, tym razem ślimaka XD

[Troll81]

Tłumaczenie zakończone. poprosze o szlify.

[MarcinB]

Trochę zaskoczyli z tym. Ale to dobrze idziemy do przodu :)

[Aegis Maelstrom]

Podszlifuję w wolnej chwili, dobra robota!  :p_arr:

Trzeba będzie jeszcze news strzelić o zmianach w WCG (i przy okazji warto obserwować ich fora, info o przygotowywanym nowym projekcie już było, a to nie jedyne nowości).

[Ufol]

A co się jeszcze szykuje?

[Aegis Maelstrom]

Chociażby Help Conquer Cancer na GPU, o którym piszę tu już trzeci raz (do tej pory bez odzewu - nikt mnie nie czyta czy jak?  %) ).

[Troll81]

czytamy i co poniektórzy szykują się :D

[Ufol]

Oczywiście, że czytamy. Myślałem, iż jeszcze coś planują. Tego nowego podprojektu jeszcze nie mieliłem. Jakie są wasze wrażenia. Próbki długie?

[mimeq]

zassaly sie przypadkiem na clouda (narazie nie licze tego podprojektu):

SN2S_ A37114_ 0000014_ 0191_ 1--   mc-178-32-116-71.ovh.net    In Progress   22.02.12 17:56:13   03.03.12 17:56:13   0.00   0.0 / 0.0
SN2S_ A37114_ 0000014_ 0718_ 0--   mc-178-32-116-71.ovh.net    In Progress   22.02.12 17:52:28   03.03.12 17:52:28   0.00   0.0 / 0.0
SN2S_ A37114_ 0000014_ 0555_ 1--   mc-178-32-116-71.ovh.net    Valid   22.02.12 17:52:14   24.02.12 13:25:37   6.95   141.1 / 128.2
SN2S_ A37114_ 0000014_ 0572_ 0--   mc-178-32-116-71.ovh.net    Valid   22.02.12 17:52:14   24.02.12 13:25:37   6.85   139.2 / 126.0
SN2S_ A37114_ 0000014_ 0620_ 1--   mc-178-32-116-71.ovh.net    Pending Validation   22.02.12 17:52:14   24.02.12 18:39:09   9.30   188.9 / 0.0
SN2S_ A37114_ 0000014_ 0671_ 1--   mc-178-32-116-71.ovh.net    Pending Validation   22.02.12 17:52:14   24.02.12 13:25:37   6.34   128.7 / 0.0

[MarcinB]

Chociażby Help Conquer Cancer na GPU, o którym piszę tu już trzeci raz (do tej pory bez odzewu - nikt mnie nie czyta czy jak?  %) ).

Gdzieś czytałem ;p i czekam z niecierpliwością szykując na to nowy sprzęt :) Mam nadzieje że projekt ruszy w tym roku

[Bezprym]

Say No To Schistosoma to kolejny podprojekt WCG z którym się żegnamy - w tym wypadku tymczasowo.
Na forum poinformowano, że na razie nie będzie nowych WU, a projekt otrzymał status Intermittent.

Kod [Zaznacz] Rozwiń

https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,35257_offset,0#424478

Tak więc pozostały już tylko trzy aktywne podprojekty WCG.

[_Aleksander_]

Dostępna jest nowa partia WU. Napełniać bufory, kto potrzebuje do kolejnej odznaki  :attack:

[Dario666]

Nowe zadania na pół roku:

This is a brief update about the Say No To Schistosoma Project on World Community Grid. The researchers have constructed a new web site look which can be seen here: http://www.schistosomaonline.com.br. They have added 19 new protein targets to the project and these are listed here: http://www.mestradoti.com.br/schistosoma/targets . Over 4 million additional candidate compounds are being added to the project and we should start running the screenings for these on the grid soon after the data is prepared. The researchers have one paper submitted to a journal for review and have written another paper which should be submitted soon. We will post news items about these papers when they are published. The researchers have done some preliminary laboratory testing of the best candidate compounds. Before human testing of the best candidate compounds can proceed, the Brazilian Research Ethics Committee must approve this testing request. The approval process is expected to take 6 to 8 months. The researchers thank all of the generous volunteers who make this project possible.